序言：过去研究的情况、方法、目的和所获得的主要成果或特点。这段文字不宜超过100～200字。
材料和方法：这是执行科研的关键部分，对于要进行的研究工作，必须按照实际情况，在事先：⑴选择好合适的即合乎一定条件的、一定数量的研究对象；⑵采用一定的实验、诊断或治疗方法（包括实验步骤、方法、器材试剂、药品)；⑶经过一定时期的观察，相同条件下的对照组，与他人结果比较并综合分析。这部分内容要求简明准确、材料完整及可信。
结果：把全部原始资料集中起来，在处理这些原始资料时，应是随机，客观地加以分析，不应有意无意地加以挑选。对于一些阴性结果，不必一一列出。尽量组织严密，符合逻辑、进行对比观察。
讨论：论文中很重要的部分，其主要任务是探讨“结果”的意义。
讨论的主要内容包括：⑴主要的原理和概念；⑵实验条件的优缺点；⑶本人结果与他人结果的异同，突出新发现、新发明；⑷解释因果关系，说明偶然性与必然性；⑸尚未定论之处，相反的理论；⑹急需研究的方向和存在的主要问题。
“讨论”的内容也以精简为原则，要能讲清楚主要的论点，已经谈过的不宜在这一节里予以重复。在结论的问题中避免以假设来“证明”假设，以未知来说明未知，并依次循环推论。
参考文献：列出参考文献的目的，在于引证资料（包括观点、方法等)的来源，不可从别人的论文中转抄过来。
内部资料，非经正式发表者，一般不作文献引用，为此一般要求引用文献者必须用阅读过的重要的、近年的文献为准。论著10条左右，论著摘要3～5条，综述20条左右。
医学论文的产生过程
选题阶段：论文的选题，也即是科研的选题，有时一项科研可产生多篇论文。选题过程一般可分为三步：
初拟题目：在这项工作之前必须手中有信息、资料和设想，当然可以是前瞻性研究或回顾性总结，大致可有以下几个方面：⑴临床遇到的罕见病和疑难病例；⑵危重病人的诊治经验；⑶阅读国内外文献、参加学术会议受到的启发，进行技术和方法的移植研究；⑷新药、新仪器的临床应用，新的诊断方法及治疗经验；⑸上级布置或招标的题目。在初步考虑拟选题目之后，应进行全面的文献检索，避免题目类同、结论陈旧和不符合客观事实。在别人研究成果基础上寻找尚未解决的问题作为自己的研究题目。
实验研究阶段：这包括应用国外或国内的先进手段、药物、手术方法、检测等进行临床试用、观察和随访调查，并用动物或正常人作对照试验，要求详细记录各种数据及资料，作为论证和评价成果的依据。
整理、分析资料和总结阶段：对以上资料进行统计分析，绘制图表，临床分析和比较，得出显效、有效和生存率、死亡率、发病率等结论，并分析其相互关系，引证文献作对比。分析成功和失败的原因及制约因素，并对病因学、流行病学、发病机制进行论证，包括预后的估价。最后对论文作出自我评价，提出有待进一步探讨的问题。
撰写论文阶段：该详则祥，该简则简，文字简练，用语准确，恰如其氛，切忌浮夸和虚构。当然，在产生论文以前，每位作者必须学会文献检索，统计学的基础知识的X2检验、T检验、F检验、相关分析、回归运算、如何选择样本大小等，努力阅读医学情报信息和文献积累，在实践中不断总结，逐步提高写作水平，这样才能水到渠成写出真正好的论文。
医学论文撰写中的常见问题
科研设计的选题与立题问题
标题太长，主题不突出。
标题与内容不符，或题目太大而内容贫乏。
标题单调，主题不明确。
关于题目要求：⑴可检索性；⑵特异；⑶明确；⑷简短。
